阿衡之死令黃藥師(曾江 飾)傷心欲絕，遂決定與阿衡一同離開桃花島，周伯通(秦煌 飾)見狀，笑謔黃藥師與阿衡一同尋死，更說出郭靖(黃日華 飾)早已背熟九陰真經(jīng)，黃藥師聞言大怒。原來黃藥師發(fā)誓，凡懂九陰真經(jīng)者死，因而往殺郭靖，郭靖不知情，大感莫名其妙，后周伯通將經(jīng)書撕毀，終冰釋干戈，但黃藥師不許黃蓉(翁美玲 飾)跟隨郭靖等人離開桃花島。黃蓉思念郭靖，遂毅然向黃藥師辭行，卻見黃藥師與阿衡同在冰牢內(nèi)，黃藥師已一頭白發(fā)，而母親已死去，大驚之下，追問因由，黃藥師向她明言一切。原來十多年前，東邪、西毒、南帝、北丐、中神通為奪九陰真經(jīng)，在華山論劍，結(jié)果真經(jīng)落在中神通王重陽手中，多年后，重陽知壽緣已盡，恐真經(jīng)落在壞人手中，命師弟周伯通將真經(jīng)上、下冊分別收藏，伯通選擇桃花島為藏經(jīng)之地，藥師甚想得到經(jīng)書，遂與伯通打賭，使阿衡得以背誦經(jīng)文，然后詐稱經(jīng)書乃偽本，伯通信以為真，將經(jīng)書焚毀，而阿衡則為黃藥師將經(jīng)文默出，豈料經(jīng)書被梅超風(fēng)、陳玄風(fēng)偷去，黃藥師懇求阿衡再之背寫，但阿衡苦思亦不能將全部經(jīng)文背出，更因辛勞過度，終于產(chǎn)下女兒后死去，藥師便為阿衡建造冰牢，十多年來為之搜羅天下奇藥醫(yī)治，可惜仍是徒勞無功。